エリア2のボスを倒して「CRASH」を入手後、エリア2の左記の場所にある壁を破壊しましょう。
開通した道の先にエリア3への通路があります。
エリア3は敵の攻撃が激しいので、向かう前にサブウェポンを集めておくといいでしょう。

ボスがいる基地へ通じるS字通路の後半はこのエリアで最も敵の攻撃が激しい場所です。
足場の良くない場所に沢山の敵が現れるので、被弾の可能性が非常に高くなります。
事前にホーミングかマルチミサイルを多めに用意し、目の前に現れる敵に対して連射しながら一気に突破しましょう。

少し手強いボスです、GUNパワーが最大かどうかで大幅に難易度が変わります。
行動パターンは「ワープ + 移動攻撃 or 静止攻撃」を繰り返します。
ワープ前に自分の分身を残します。
分身は動かず攻撃もしません、破壊可能な障害物です。
初期のワープ先は分身が無い位置へランダムに出現しますが、発狂状態になると分身のある場所に出現するようになります。

移動攻撃の場合、出現位置から上下左右の何れかに直進しつつ、半ホーミングのビームをさみだれ撃ちします。
通常時はビームの速度も遅いですが、発狂状態になると移動とビームの速度が増し、危険度が一気に上昇します。

静止攻撃の場合は出現時に短時間点滅したのちに出現位置とケインの位置を基準に、上下左右のいずれかに3WAYのビームを数発発射します。
3WAYの射角は固定なので、最初の1発目をかわすことができるかどうかが重要です。
発狂状態になると出現から攻撃までの間隔が短くなる、ビームの速度も上昇します。

分身の位置を参考に出現位置を絞り込み、出来る限り距離を取ってビームをかわしやすくしましょう。
重要なのは移動攻撃と静止攻撃を瞬時に見分けることです。出現時に点滅するかどうかで見分けましょう。
発狂時はそれまでに残した分身が出現位置になるので、それを目安に位置取りがしやすくなるはずです。